近日，中国热带农业科学院椰子研究所在《International Journal of Molecular Sciences》发表了题为“Genome-Wide Identification and Characterization of AP2/ERF Transcription Factor Family Genes in Oil Palm under Abiotic Stress Conditions”的研究论文。
AP2/ERF超家族作为植物最大的转录因子家族之一，在植物的生长、发育、新陈代谢以及对生物及非生物胁迫反应中起着至关重要的调控作用。油棕作为典型的热带木本油料作物，其产量和品质受到低温、干旱及高盐等逆境的影响。基于油棕基因组数据，利用生物信息学分析方法，椰子所首次完成了油棕AP2/ERF家族成员的鉴定与分析。共获得172个油棕AP2/ERF超家族基因，并将其划分成AP2（34）、ERF（131）、RAV（5）和Soloist（2）家族。每个家族均具有保守motif和基因结构，推测这些基因有可能与油棕种属的特异性有关；通过对拟南芥、水稻及油棕构建系统发育树，可以推测出油棕起源进化及亲缘关系，为后续遗传操作提供参考；同时通过基因共线性分析发现油棕16条染色体均存在基因复制对，其中3号、5号、13号、14号和15号染色体上的基因复制对较多，通过基因复制时间可估算出油棕种间的分歧时间；利用荧光定量PCR分析其在低温、干旱及高盐胁迫下的表达变化，初步明确15个逆境响应的AP2/ERF基因（EgAP2.25, EgAP232, EgAP2 34，EgERF07, EgERF14, EgERF23, EgERF26, EgERF42, EgERF73, EgERF90, EgERF104, EgERF125, EgERF129, EgERF130和EgRAV02），该研究丰富了油棕的特殊基因库，明确了参与油棕抗逆胁迫的转录调控因子，为深入探索油棕非生物胁迫响应分子机制、构建抗逆调控网络及油棕品种抗逆改良奠定基础。
油棕果形态和油棕AP2、ERF、RAV及Soloist基因共线性分析组图
《International Journal of Molecular Sciences》为中科院JCR二区的TOP期刊，最新影响因子为4.556。文章第一作者、通讯作者为中国热带农业科学院椰子研究所周丽霞。该项工作得到了国家自然科学基金（No. 31870670）的支持。
文章链接：https://www.mdpi.com/1422-0067/22/6/2821#
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